平家討伐に最も勲功のあった源義経も、兄・頼朝から疑いをかけられ、追われる身となります。偽山伏に姿を変え、奥州を頼んで落ち延びようとする義経主従の一行を、頼朝は国々に新しく関所を設けて取り締まろうとします。加賀国・安宅には、富樫某(ワキ)が下人(間狂言)とともに関所を守っています。

義経(子方)、武蔵坊弁慶(シテ)、伊勢の三郎以下の一行は、都を出てやっと安宅にたどり着きますが、関のあることを聞いて、強力(間狂言)に様子を見にやらせます。しかし、なかなか用心が厳しいので、弁慶は策を案じ、義経を強力に仕立てて、南都東大寺勧進のための一行だと言って通ろうとします。

富樫は一人も通さず斬殺すと言うので、弁慶はそれでは仕方なく討たれようと、最期の勤行をしますが、山伏を殺せば天罰が当ると威嚇するので、富樫某は少しひるみ、東大寺勧進の為ならば「勧進帳」があるはずと、弁慶に読むようにと言います。勧進帳など持っている訳はありませんが、弁慶は巻物を勧進帳と偽って読み上げ、いったんは関所の通過を許されます。しかし、強力姿に変装した義経が見咎められてしまい、弁慶のとっさの機転で、足弱なため疑われるのだと罵り、金剛杖で散々に打ち据え、義経を立たせて行こうとすると、富樫が詰め寄るので、笈に目を付けられるとは、盗人ではないかと一行も富樫に詰め寄り、刀に手を掛けます。

その場を逃れ危機を脱した一行は、山陰に憩い、主君の不運に涙していると、富樫が後を追って、先刻の非礼を詫びるため酒を持って現れます。一同は酒宴となり、弁慶は主君の延年を祈って舞を舞い、富樫に暇を告げると一行に先を急がせ、陸奥の国へと下って行くのでした。

左大臣（現在の首相）家の娘で、光源氏の正妻・葵上は、物の怪に悩まされ、高僧たちの祈祷も空しく病床にありました。臣下（ワキツレ)は物の怪の正体を知るため、「梓弓」の名手である照日の巫女（霊媒師・ツレ）を招きます。巫女が梓弓を鳴らしながら招魂の呪文を唱えると、火宅の門をでることができない（嫉妬心を捨てきれない）身を嘆きながら、破れ車に乗った貴婦人姿の生霊（シテ）が現れます。巫女と臣下が名を問うと、生霊は六条御息所と名乗り、人生は短く儚いのに、どうして浮き出てしまったのだろうと独り呟きます。そして皇太子妃として栄華を誇っていた頃を懐かしむと同時に、容姿も衰え、源氏の寵愛をも失ってしまった身を嘆きつつ、燃え出した嫉妬の怨みを晴らすために現れたと告げます。そして葵上への怨みを述べていくうちに生霊の執心は益々募り、遮ろうとする巫女を振り切って葵上を打ち据え、破れ車に乗せて連れ去ろうと言い残して姿を消します。（中入）

臣下は、一大事と従者（間狂言）に命じて、比叡山の高僧である横川の小聖（ワキ）に生霊退治を求めます。小聖が祈祷を始めると、鬼女に変じた六条御息所が打ち杖を持って再び現れ、更に祟りを為そうとします。それを防ごうとする小聖の間で激しい争いとなりますが、遂に祈り伏せられ、心を和らげて成仏します。